Para esto se puede usar la función bloginfo() que ofrece WordPress.
Por ejemplo si la imagen de su Header está en /wp-content/themes/mi-tema/images/header.jpg en vez de llamarla así:
<img src="http://www.example.com/wp-content/themes/mi-tema/images/header.jpg" />
Se puede hacer:
<img src="<?php bloginfo('template_url'); ?>/images/header.jpg"/>
Que es mucho más simple y genérico. El uso de bloginfo() recibe muchos otros parámetros y permite una estructura orientada hacia el uso de temas (por ejemplo mantener en el directorio del tema todas las imágenes, scripts, etc).
Visite http://codex.wordpress.org/Template_Tags/bloginfo para la documentación completa.